Не понятная ситуация. Что, плёнки по крестам не сходятся?
Рисовать можно и в Кореле, и в Иллюстраторе, и во Фрихенде, и в Шопе, да хоть в Ворде!
Вы-бы поконретнее описали ситуацию. Что Вы носите в типографию: верстку или постскрипт? Если постскрипт, то какой: сепарированный или композит? Как Вы раскрашивали эти три цвета: PMS, CMYK, RGB ? Оверпринтинг был расставлен в верстке? Из типографии Вы получили только плёнки или плёнки и тираж? В тираже есть котрольный оттиск (подписной лист) необрезанными мишенями (метками совмещения)?
О плоттерах. Согласен, неухоженные разболтанные роланды дают погрешность. У нас старенький 960, но на метре нет 2мм. Особенно если не “елозить” плёнку взад-вперед.